全國代理暨代課教師產業工會理事長黃湘仙16日晚間在臉書公開發文，點名劉錦璋長期以來在教學上存有不當作為。她透露，劉任教於競技系、負責必修課程期間，曾發生一名學生雖成績達標卻仍被當掉的情況。學生詢問原因時，竟遭劉回應：「我就是要教訓你。」黃痛批：「難道教授可以把『開必修課』當作懲罰學生的工具？」
這番發言引來不少網友共鳴，不少人留言表示師範體系長期存在權力濫用問題，「不只這個系，體育院很多老師都是這樣。」
除了留言風波與教學爭議外，網友也挖出，劉錦璋曾與台師大女足教練周台英合作研究，兩人聯名發表的論文《補充L-精胺酸八週對於女子足球選手無氧動力、肌肉損傷及發炎反應之影響》於2022年刊登在《運動表現期刊》，但該篇研究已於隔年因「涉及學術倫理」被撤稿。
面對連串質疑，劉錦璋曾在臉書發出聲明稱：「該負責的人要負責，該道歉的人要道歉，而不是整個單位每個人都要道歉」，他也反問：「我到底嗆了誰？傷害誰了？我該為誰道歉？」對於外界批評，劉表示感到無奈。