馬祖馬拉松最獨特的亮點，莫過於「軍事坑道限定賽道」。平時封閉的南北坑道，僅在馬拉松當天開放，跑者得以穿越昔日戰備要塞，親身感受地底長廊的壓迫與壯觀，挑戰鋼鐵般的地形。這樣的特殊設計，也讓馬祖馬拉松成為許多跑者人生清單上的夢幻賽事。
沿途的自然景致同樣令人驚艷。賽道串聯馬祖地標，包括福澳港、海岸步道與歷史據點，讓人一邊揮汗奔馳、一邊飽覽壯闊海景與獨特離島風貌。大海、風車、碉堡與老建築構成如畫風景，每一步都是打卡點。
馬祖馬拉松最令人期待的，還有補給站變身「美食大會」。今年主辦單位與多家在地餐廳合作，推出淡菜、紅糟雞塊、繼光餅、高粱香腸、黃金地瓜酥等馬祖在地特色小吃，讓跑者一路吃好吃滿，補充能量也補充在地文化。
競賽組別包括全馬42K（報名費1,300元）、半馬21K（1,100元）、10K挑戰組（900元）與5K健康休閒組（350元）。即日起至8月8日止報名享88折早鳥優惠（健康組不折扣），不論你是專業跑者、親子家庭或離島探險迷，都能找到適合自己的節奏。
獎勵部分也誠意滿滿。全馬男女冠軍可獲得「體重等重馬祖高粱酒」，完賽者還可帶走限量紀念酒一瓶，總獎金高達50萬元。用腳步換高粱、用汗水換榮耀，這就是最有馬祖精神的獎勵。