人事總處培訓考用處長李花書指出，本次修正案內容主要涉及兩個部分，包含配合國安五法修正，將涉及國安五法的重大國安犯罪類型列為特查項目之一；另增加查核頻次，特查職務滿一定期間，就須定期辦理特查。李花書說，相關首長辦公室裡面的人若非任用法適用範疇，則會請他們填寫自願書，以完備國家安全查核。
行政院發言人李慧芝表示，政院五長及其辦公室所有人員都會優先辦理首波特殊查核，明天起就會陸續啟動查核，但因特殊查核期程要送調查局辦理，需要一點時間。
此外，根據行政院公告辦法，考量威脅國家安全或重大利益的境外敵對勢力，除外國情治單位、大陸地區或香港、澳門官方或其代表機構，國內近年陸續偵辦多起國安犯罪案件型態，顯示滲透來源已擴及境外敵對勢力實際控制或管理的具政治性機關（構）、團體或其派遣者，因此這次也增列「未經許可或授權，曾與具政治性機關（構）、團體或其派遣之人聯繫接觸者」或受其利誘、脅迫者，皆納入查核範圍。
公告辦法也指出，同居關係屬現代重要生活型態，且同居人雖非配偶，惟其與當事人的生活關係相當緊密，因此這次將特殊查核公務人員的同居人，以及同居人的父母都列入調查範圍。
查核辦法明定，經特殊查核有相關情事者，法務部調查局得經當事人書面同意後，蒐集其財稅、信用卡、銀行存款、債務、授信及匯款紀錄等財務資訊。當事人不同意者，擬任人員應不得任用為前條所定職務，但可擔任前條以外的職務；現職人員除機要人員應免其機要職務外，應依法調整為前條以外的職務。